Гусиноозерское буроугольное месторождение разрабатывается с 1963 г. Холбольджинским угольным разрезом, расположенным на берегу Гусиного озера. Озеро входит в водоохранную зону оз. Байкал, что требует особого внимания к природоохранным мероприятиям при эксплуатации месторождения.
Горными выработками дренируются подземные воды продуктивных меловых угленосных отложений. Глубина залегания уровня подземных вод в естественных условиях составляла а среднем 15—17 м, В результате многолетней эксплуатации разреза уровень (напор) подземных вод понизился на 2—56 м в зависимости от расстояния до центра депрессионной воронки. Изменилось направление движения и разгрузки подземного потока. Областью разгрузки подземных вод являются в настоящее время действующие горные выработки разреза.
По своему химическому составу подземные воды разрабатываемого месторождения — сульфатно-натриевые, не пригодные для хозяйственно-питьевого водоснабжения.
Проведенные по акватории озера территории разреза геофизические и геохимические исследования показали значительное влияние углевмещающих пород и отвалов на формирование химического состава карьерных вод. В настоящее время разгрузка подземных вод угленосных отложений в озеро и прямая гидравлическая связь между ними не установлены.
Для предотвращения перетока с территории разреза подземных и карьерных вод в озеро необходима разработка и осуществление мероприятий, обеспечивающих сохранность гидрогеологических условий района близких к естественным, а также сохранение водонепроницаемости донных отложений озера.
